导读 血液蛋白组学技术怎么选？看这一篇就够了！ 近年来，血液蛋白质组学在疾病标志物发现和临床研究中扮演着越来越重要的角色。然而，面对众多蛋白质组学技术平台，研究人员如何选择最合适的工具？一项由Alkahest Inc.团队开展的研究对七种主流蛋白质组学平台进行了全面比较，凸显了 SOMAmer 试剂检测蛋白组在覆盖范围、数据完整性和技术稳定性方面的显著优势。 1. 研究背景与方法 血浆中含有丰富的蛋白质，这些蛋白质不仅是生理过程的执行者，也是疾病的重要标志物。然而，血浆蛋白质的动态范围极广（跨越10个数量级），且易受年龄、性别、BMI等因素影响，这对检测技术提出了极高要求。目前，蛋白质组学技术主要分为两大类：基于亲和力的方法（如基于 SOMAmer 的SomaScan、基于抗体的 Olink）和基于质谱（MS）的方法。 为了客观比较这些技术的性能，本研究对同一组78名健康受试者的血浆样本进行了分析，覆盖了七种平台： * 基于SOMAmer 的 SomaScan 11K、SomaScan 7K * 基于抗体的 Olink Explore 3072（3K）、Olink Explore HT（5K） * 基于纳米颗粒富集的Seer Proteograph(TM)（MS-Nanoparticle） * 基于高丰度蛋白去除的 Biognosys TrueDiscovery(TM)（MS-HAP Depletion）

* 高精度的靶向质谱技术 SureQuant(TM)（MS-IS Targeted）

       

2. 技术比较的核心发现 (1) 覆盖范围：基于SOMAmer的检测方法遥遥领先 SomaScan 11K检测到了9,645种独特的血浆蛋白质，远超其他平台（如Olink 5K的5,416种和MS-Nanoparticle的5,943种）。更重要的是，SomaScan 11K贡献了3,610种 unique protein，这些蛋白质未被其他任何平台检测到。这一优势使其成为发现新生物标志物的强大工具。 (2) 数据质量与稳定性 技术变异系数（CV）：SomaScan的技术CV中位数仅为5.3%（11K）和5.8%（7K），远低于Olink 5K的26.8%、质谱平台的26.4%-29.8%。低CV值表明基于SOMAmer的检测结果更稳定可靠。 数据完整性：SomaScan 11K 和 7K 的数据完整率分别高达96.2%和95.8%，而Olink 5K 仅为35.9%，质谱平台也普遍低于60%。 (3) 临床相关性 SomaScan覆盖了88%的美国FDA批准的蛋白质标志物，显著高于Olink（57%）和质谱平台（73%）。此外，在识别与年龄、性别和BMI相关的生物标志物时，SomaScan 11K的表现最佳，例如发现了2,170个与年龄显著相关的蛋白质（是其他平台的2-10倍）。 3. 结论 这项研究证实，基于SOMAmer 的检测方法在蛋白质组学领域具有不可替代的优势：广泛的覆盖范围、卓越的数据质量和出色的临床相关性。无论是探索未知的生物标志物，还是验证已知的疾病靶点，基于SOMAmer 的检测方法都能提供更可靠、更全面的数据支持。 2025年6月23日，Illumina 公司宣布，已与Standard BioTools达成最终协议，将以3.5亿美元现金外加高达7,500万美元的近期绩效里程碑款项及业绩相关版税（总现金对价高达4.25亿美元，即30.48亿元人民币）收购SomaLogic。 Illumina 将高灵敏性的SOMAmer 与自有的 NGS 平台结合，推出了基于高通量测序的血液蛋白组学解决方案 IPP（Illumina Protein Prep）。

IPP 技术平台参数如下

       

欧易生物作为目前国内首家、华东地区独家引进IPP 技术平台的服务商，即将开始推出 IPP 蛋白组研究服务，欢迎感兴趣的老师前来咨询。 END

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欧易生物简介 Oebiotech

欧易生物是一家致力于为生命科学研究提供多组学技术的研究服务机构，产品涵盖单细胞及时空多组学、基因组学、转录组学、表观组学、蛋白组学、代谢组学、生物信息学以及临床诊断产品开发，秉承「以生物科技 成就他人 造福大众」的企业使命，用技术改变生活，用科技造福人类。

       

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